- De tabulis Eugubinis. Berlin 1833 (Dissertation) IA = Google, IA = Google, MDZ München
- Palaeographie als Mittel für die Sprachforschung. Berlin 1834 MDZ München
- Inscriptiones Umbricae et Oscae quotquot adhuc repertae sunt omnes. Leipzig 1841 IA = Google = Google = Harvard
- Das Todtenbuch der Ägypter (nach dem hieroglyphischen Papyrus in Turin). Leipzig 1842 Google, Propylaeum-DOK
- Denkmäler aus Aegypten und Aethiopien : Nach d. Zeichn. der von Seiner Majestät dem Könige von Preussen Friedrich Wilhelm IV nach diesen Ländern gesendeten u. in d. Jahren 1842-1845 ausgeführten Expedition. 5 Bände. Leipzig 1849-1913 Lepsius-Projekt Sachsen-Anhalt
- Die Chronologie der Ägypter. Berlin 1849 Google = Internet Archive
- Über den ersten aegyptischen Götterkreis und seine geschichtlich-mythologische Entstehung. Berlin 1851 Google
- Briefe aus Aegypten, Aethiopien und der Halbinsel des Sinai: geschrieben in den Jahren 1842 - 1845 während der auf Befehl Sr. Maj. des Königs Friedrich Wilhelm IV von Preußen ausgeführten wissenschaftlichen Expedition. Berlin 1852 Google = Internet Archive, UB Heidelberg
- Über einige Ergebnisse der ägyptischen Denkmäler für die Kenntnis der Ptolemäergeschichte. Berlin 1853 Google, UB Heidelberg
- Über die zwölfte ägyptische Königsdynastie. Berlin 1853 MDZ München
- Über eine hieroglyphische Inschrift am Tempel von Edfu (Appollinopolis Magna) in welcher der Besitz dieses Tempels an Ländereien unter der Regierung Ptolemaeus XI., Alexander I. verzeichnet ist. Berlin 1855 MDZ München, Google = Internet Archive
- Das allgemeine linguistische Alphabet. Berlin 1855 MDZ München, Google = Internet Archive
- Über die XXII. ägyptische Königsdynastie nebst einigen Bemerkungen zu der XXVI. und anderen Dynastien des Neuen Reichs. Berlin 1856 Google
- Über die Götter der vier Elemente bei den Ägyptern. Berlin 1856 Google
- Über die manethonische Bestimmung des Umfangs der ägyptischen Geschichte. Berlin 1857 Google = Internet Archive
- Standard Alphabet for Reducing Unwritten Languages and Foreign Graphic Systems to a Uniform Orthography in European Letters, Williams & Norgate, 1863 MDZ München, Internet Archive, Google
- Die alt-aegyptische Elle und ihre Eintheilung. Berlin 1865 Google = Internet Archive
- Nubische Grammatik : mit einer Einleitung über die Völker und Sprachen Afrikas. Berlin 1880 Internet Archive
- Die Längenmasse der Alten. Berlin 1884 Internet Archive
- Aelteste Texte des Todtenbuchs nach Sarkophagen des Altaegyptischen Reichs im Berliner Museum. Wilhelm Hertz, Berlin 1867 MDZ München
- Die Eugubinischen Tafeln. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 2 (1834), S. 191–197 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Über die πρῶτα στοιχεῖα in der Stelle bei Clemens Alexandrinus über die Schrift der Ägypgter. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 4 (1836), S. 142–148 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Abhandlungen und Berichte bei der Königlich Preußischen Akademie der Wissenschaften zu Berlin. Digitalisate bei BBAW.
- Über einige Aegyptische Kunstformen und ihre Entwickelung. In: Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin / Philosophisch-historische Klasse. Jahrgang 1871 (1872), 1. Abt. S. 1–26 Berlin-Brandenburgische Akademie
- Die Metalle in den Aegyptischen Inschriften. In: Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin / Philosophisch-historische Klasse. Jahrgang 1871 (1872), 1. Abt. S. 27–143 Berlin-Brandenburgische Akademie
- In: Zeitschrift für ägyptische Sprache und Altertumskunde
- Artikelliste siehe
- Heinrich Brugsch: Gedenktafel der Zeitschrift für ägyptische Sprache und Alterthumskunde an Karl Richard Lepsius. Band 22 (1884), S. 47–48 Internet Archive
- Inhaltsverzeichnis für Band 1–40. Band 40 (1902/3), S. 156 Internet Archive
- Übernahme der Redaktion. Band 2 (1864), S. 81 Internet Archive
- Die Sethos-Tafel von Abydos. Band 2 (1864), S. 81–83 Internet Archive
- Texte des Todtenbuches aus dem Alten Reiche. Band 2 (1864), S. 83–89 Internet Archive
- Ueber „rechts“ und „links“ im Hieroglyphischen. Band 3 (1865)
- Die neue Königstafel von Abydos und Herr Dümichen. Band 3 (1865)
- Ueber die mit den Nomenlisten verbundenen geographischen Namenreihen. Band 3 (1865), S. 38–43 Internet Archive
- Erläuterungen zu einer koptisch-arabischen Handschrift. Band 3 (1865), S. 52 Internet Archive
- Ueber die Zeichen , und in den topographischen Listen. Band 3 (1865), S. 60–64 Internet Archive
- Ueber die hieroglyphische Gruppe als Orgyia von 4 Ellen oder 6 Fuß. Band 3 (1865), S. 96–98 Internet Archive
- Die Regel in den hieroglyphischen Bruchbezeichnungen. Band 3 (1865), S. 101–110 Internet Archive
- Notizen. Band 4 (1866), S. 28 Internet Archive
- Entdeckung eines bilinguen Dekretes durch Lepsius. Band 4 (1866)
- Ueber die Umschrift der Hieroglyphen. Band 4 (1866), S. 73–81 Internet Archive
- Ueber denselben Obelisk. (Zu Franz Joseph Lauth: „Der Obelisk in der Münchner Glyptothek“, S. 92ff.). Band 4 (1866), S. 95–96 Internet Archive
- Zu Franz Joseph Lauth: „Noch einmal der Münchner Obelisk“, S. 17ff.. Band 5 (1867), S. 20 Internet Archive
- Zu dem vorstehenden Artikel des Herrn Baillet. (Aug. Baillet: „De la transcription des hiéroglyphes“, S. 66ff.). Band 5 (1867), S. 70–72 Internet Archive
- Das Sothisdatum im Dekret von Kanopus. Band 6 (1868), S. 35–36 Internet Archive
- Ueber eine zu Pompeji gefundene hieroglyphische Inschrift. Band 6 (1868), S. 85–89 Internet Archive
- Nachtrag zu dem vorstehenden Artikel. (Heinrich Brugsch: „Ueber die vier Elemente in altägyptischen Inschriften“, S. 122ff.). Band 6 (1868), S. 127–128 Internet Archive
- Die Kalenderreform im Dekret von Kanopus. Band 7 (1869), S. 77–81 Internet Archive
- Der letzte Kaiser in den hieroglyphischen Inschriften. Band 8 (1870), S. 25–30 Internet Archive
- Ueber die Annahme eines sogenannten prähistorischen Steinalters in Aegypten. Band 8 (1870)
- Einige Bemerkungen über denselben Papyrus Smith. (Zu Aug. Eisenlohr: „Der doppelte Kalender des Herrn Smith“, S. 165ff.). Band 8 (1870), S. 167–170 Internet Archive
- Des Sesostris-Herakles Körperlänge. Band 9 (1871), S. 52–56 Internet Archive
- Der Bogen in der Hieroglyphik. Band 10 (1872), S. 79–88 Internet Archive
- Kupfer und Eisen. Band 10 (1872), S. 113–118 Internet Archive
- Nachruf: Vicomte Emmanuel de Rougé. Band 11 (1873), S. 23–24 Internet Archive
- Hieroglyphische Inschriften in den Oasen Χārigeh und Dāχileh. Band 12 (1874), S. 73–80 Internet Archive
- Trinuthis und die ägyptischen Oasen. Band 12 (1874), S. 80–83 Internet Archive
- Vom internationalen Orientalisten-Congreß in London. Band 13 (1875), S. 1–5 Internet Archive
- Über den Kalender des Papyrus Ebers und die Geschichtlichkeit der ältesten Nachrichten. Band 13 (1875), S. 145–157 Internet Archive
- Aufforderung (bzgl. kritischer Ausgabe des Todtenbuchs). Band 14 (1876), S. 48 Internet Archive
- Notiz (Wāhʿ el bahʿrīyeh). Band 14 (1876), S. 120 Internet Archive
- Das Stadium und die Gradmessung des Erastosthenes. Band 15 (1877), S. 3–8 Internet Archive
- Über die widderköpfigen Götter Ammon und Chnumis, in Beziehung auf die Ammons-Oase und die gehörnten Köpfe auf griechischen Münzen. Band 15 (1877), S. 8–22 Internet Archive
- Die Babylonisch-Assyrische Längenmaß-Tafel von Senkereh. Band 15 (1877), S. 49–58 Internet Archive
- Eine Aegyptisch-Aramäische Stele. Band 15 (1877), S. 127–132 Internet Archive
- Bemerkung (bzgl. Pyramide des Unas). Band 19 (1881), S. 15 Internet Archive
- Die XXI. Manethonische Dynastie. Band 20 (1882)
- Eine Sphinx. Band 20 (1882), S. 117–120 Internet Archive
- Über die Lage von Pithom (Sukkoth) und Raēmses (Heroonpolis). Band 21 (1883), S. 41–53 Internet Archive
- Über die Maße im Felsengrabe Ramses IV. Band 22 (1884), S. 1–5 Internet Archive
- Über die 6 palmige große Elle von 7 kleinen Palmen Länge in dem „Mathematischen Handbuche“ von Eisenlohr. Band 22 (1884), S. 6–11 Internet Archive
- Das Archivmaterial der Lepsius-Expedition BBAW