- Vater: Adelbert von Keller (1812–1883), Romanist und Germanist
- Sohn: Siegmund Otto Keller (1870-1943), Rechtswissenschafter und Bibliotheksrat
- Sohn: Wolfgang Keller (1874-1943),Literaturwissenschaftler und Neuphilologe
- Untersuchungen über die Geschichte der griechischen Fabel. In:Jahrbücher für classische Philologie. Supplementband 4 (1861–1867), S. 307–418 Google; Sonderdruck Leipzig 1862 IA = Google
- Ueber die Quellen des Plutarch in der Lebensbeschreibung des Solon, Saalfeld 1867 (Programm der Realschule und des Progymnasiums, sowie der Vereinigten Städtischen Schulen zu Saalfeld) IA = Google, Internet Archive
- Ueber den Entwicklungsgang der antiken Symbolik. Graz 1876 (Antrittsrede, gehalten zur Uebernahme der ordentlichen Professur der classischen Philologie an der kais. königl. Universität in Graz, Mai 1876) IA = Google-USA*
- Rerum naturalium scriptores graeci minores. (Band 1, mehr nicht erschienen:) Paradoxographi Antigonus, Apollonius, Phlegon, Anonymus Vaticanus. Leipzig 1877 IA = Google-USA*, IA = Google-USA*, IA = Google-USA*
- Über die Bedeutung einiger Thiernamen im Griechischen und Lateinischen, Leipzig 1878 IA = Google-USA*
- Kritische Beiträge zum IV. Buche der Horazischen Oden. In: Sitzungsberichte der Philosophisch-Historischen Classe der Kaiserlichen Akademie der Wissenschaften. Band 90 (1878), S. 143–180 Internet Archive; Sonderdruck Wien 1878 IA = Google-USA*
- Der saturnische Vers als rythmisch erwiesen. Leipzig und Prag 1883 IA = Google-USA*
- Mit Josef Häussner: Q. Horati Flacci opera. Leipzig und Prag 1885 MDZ München
- Der saturnische Vers, zweite Abhandlung. Prag 1886 IA = Google-USA*
- Thiere des classischen Alterthums in Culturgeschichtlicher Beziehung, Innsbruck 1887 IA = Google-USA*
- Zur lateinischen Sprachgeschichte. Leipzig 1893/1895
- Beschreibung der wichtigsten Horazhandschriften, Leipzig 1899 IA = Google-USA*
- Pseudacronis scholia in Horatium vetustiora. Leipzig 1902/1904
- Hunderassen im Altertum. In: Jahreshefte des Österreichischen Archäologischen Institutes in Wien. Band 8 (1905), S. 242–269 Internet Archive
- Die antike Tierwelt. 2 Bände, Leipzig 1909–1913
- Band 1: Säugetiere. 1909 HU Berlin, California-USA*
- Band 2: Vögel, Reptilien, Fische, Insekten, Spinnentiere, Tausendfüssler, Krebstiere, Würmer, Weichtiere, Stachelhäuter, Schlauchtiere. 1913 HU Berlin, California-USA*
- Eugen Staiger: Gesamtregister. Leipzig 1920 Michigan-USA*
- In: Rheinisches Museum für Philologie.
- Zur Kritik der Petronischen Cena Trimalchionis. Band 16 (1861), S. 532–551 DFG/Rheinisches Museum (PDF), JSTOR = IA
- Kritische Glossen zu Horaz’ Oden. Band 18 (1863), S. 271–285 DFG/Rheinisches Museum (PDF), JSTOR = IA
- Zur Kritik der sogenannten Acronischen Horazscholien. Band 19 (1864), S. 154–160 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Vorwort zum ersten Theil einer Ausgabe des Horaz. Band 19 (1864), S. 211–227 DFG/Rheinisches Museum (PDF), JSTOR = IA
- Ueber Horaz carm. I 4, 8. Band 19 (1864), S. 473–474 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Zu Horaz. Ueber die Unzuverlässigkeit des Cruquius. Band 19 (1864), S. 634–637 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Der Accusativus auf is der dritten Declination bei den augusteischen Dichtern. Band 21 (1866), S. 241–246 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Περσεφόνη – Prosepna. Band 30 (1875), S. 128–129 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Einige lateinische Wortformen in der Anthologie. Band 30 (1875), S. 302–304 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Munichia ein phönikischer Name. Band 30 (1875), S. 304–306 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Zu Lucilius. Band 31 (1876), S. 140–143 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Zu Horaz [c. III 4, 9. 10]. Band 32 (1877), S. 327 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- T. Afranius oder Afrenius, nicht T. Lafrenius, Feldherr der Italiker im marsischen Kriege. Band 32 (1877), S. 487–488 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Ueber die Handschriftenclassen in den Carmina und Epoden des Horaz. Band 33 (1878), S. 122–127 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Zu Porphyrion [A. p. 50]. Band 34 (1879), S. 147–149 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Lateinische Etymologien. Band 34 (1879), S. 334–339 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Etymologisches. Band 34 (1879), S. 498–500 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
- Zur Überlieferungsgeschichte des Horaz. Band 61 (1906), S. 78–90 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Artikel in Paulys Realencyclopädie der classischen Altertumswissenschaft
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